ارزیابی سطح بیان mir-181a-3p و mir-450a-5p در سرم زنان مبتلا به سرطان پستان

Abstract

با پیشرفت تکنولوژی در سال های اخیر، محدودیت مطالعات سرطان به یک یا چند فاکتور ژنتیکی و یا اپی ژنتیکی از میان برداشته شده است. در این راستا، فناوری های ریزآرایه و توالی یابی، امکان مطالعه تمامی عوامل ژنتیکی (mRNA ها) و اپی ژنتیکی از جمله (miRNA ها و lncRNA ها) را در به صورت یک پارچه و در آن واحد فراهم آورده اند. در این بین، بررسی میزان تغییرات miRNA ها به عنوان یکی از فاکتور های اپی ژنتیکی که در تنظیم بیان ژن ها پس از رونویسی نقش دارند، از اهمیت بالایی برخوردار است. مواد و روش ها: به منظور شناسایی miRNA های با اختلاف بیان معنی دار، دو دیتاست ریزآرایه مربوط به سرم زنان مبتلا به سرطان پستان آنالیز شده و دو miRNA با تغییر بیان معنی دار سرم زنان مبتلا به سرطان پستان در مقایسه با افراد سالم انتخاب شدند. در ادامه با استخراج RNA و سنتز cDNA از 100 نمونه سرم از افراد سرطانی و 100 نمونه سرم افراد سالم، سطح بیان mir-450a-5p و mir-181a-3p به کمک تکنیک Real-time PCR اندازه گیری گردید و آنالیز های آماری اختلاف میزان بیان و بیومارکری روی داده های حاصل، انجام گرفت. در نهایت با انجام آنالیز های غنی سازی، نقش این miRNA ها در تنظیم فرآیند های سلولی تعیین گردید و مورد استفاده قرار گرفت. یافته ها: ابتدا نقش و مکانیسم های سلولی و مولکولی تنظیم شونده توسط miRNA های برگزیده که در بروز و پیشرفت انواع بیماری ها از جمله انواع سرطان ها دخیل هستند، به کمک آنالیز های غنی سازی(ٍEnrichment) بررسی شدند. آنالیز غنی سازی یک روش تحلیلی است که در بیولوژی مولکولی و ژنتیک برای بررسی داده‌های ژنومیکی استفاده می‌شود. در این روش، یک مجموعه از ژن‌ها که به طور مشترک در یک مسیر بیولوژیکی یا فرایند بیولوژیکی خاص نقش دارند، مورد بررسی قرار می‌گیرد. سپس با استفاده از داده‌های ژنومیکی، ارتباط این مجموعه ژن‌ها با ویژگی‌های مختلف بیولوژیکی مورد بررسی قرار می‌گیرد. در ادامه، آزمایشات مولکولی بر روی موارد بالینی نشان دادند میزان بیان mir-181a-3p در بیماران مبتلا به سرطان پستان به صورت معنی دار افزایش یافته است، در صورتی که در رابطه با mir-450a-5p هیچگونه تغییر بیان معنی داری مشاهده نگردید. در این راستا، mir-181a-3p به میزان معنی داری می¬تواند در تفکیک افراد سالم از افراد مبتلا مفید باشد، با اینحال به عنوان یک بیومارکر با حساسیت واختصاصیت بالا به شمار نمی¬آید. در ادامه توسط آنالیز بقاء که به کمک نرم افزار تحت وب kmplotter انجام شده است، پیش آگهی miRNA های مذکور تعیین گردید.