بررسی تغییرات متیلاسیون در پروموتور ژن های ZMYND-8 و RAR-B2 در بافت توموری و حاشیه سالم در مبتلایان به سرطان ریه

Abstract

سرطان ریه به دلیل تشخیص دیرهنگام به عنوان یکی از کشنده ترین کارسینوم ها در دنیا شناخته می¬شود. یکی از تغییرات اساسی، متیلاسیون DNA است که به عنوان یکی از تغییرات اولیه رشد تومور است که یکی از شاخص های مهم برای تشخیص سرطان است. در واقع، متیلاسیون نابجای DNA یکی از شایع ترین و اولیه ترین علل تبدیل شدن به سلول های بدخیم از جمله سرطان ریه است.DNA ی متیله سلول های سرطانی در خون بیماران سرطانی یافت شده است، که نشان می دهد DNA در گردش خون یک نشانگرDNA ی مرتبط با تومور است که می تواند به عنوان یک تست تشخیصی کم تهاجمی استفاده شود. در این مطالعه، متیلاسیون ژن‌های ZMYND-8 و RAR-B2 در NSCLC را به عنوان ابزار اپی ژنتیک جدید بررسی کردیم. روش ﻛﺎر: برای شروع، به منظور یافتن قابلیت تشخیصی بالقوه متیلاسیون ژن های ZMYND-8 وRAR-B2 ، ما به طور کامل ریزآرایه های متیلاسیون DNA را از داده های اطلس ژنوم سرطان (TCGA) نمونه های NSCLC جستجو کردیم. علاوه بر این، ما با از استفاده از q-MSP در تعدادی از نمونه‌های شامل تومورهای NSCLC و بافت‌های سالم حاشیه، درجات متیلاسیون ژن‌های ZMYND-8 و RAR-B2 استفاده کردیم. نتایج: یافته¬های ما هیپو متیلاسیون عمده ZMYND-8 و هایپرمتیلاسیون RAR-B2 را در نمونه های NSCLC در مقایسه با نمونه های سالم حاشیه نشان داد که ارتباط معنی داری با مرحله بالینی بدخیمی نشان داد. علاوه بر این، دقت زیاد متیلاسیون‌های ZMYND-8 و RAR- B2 به عنوان یک شاخص قابل اعتماد برای تشخیص سرطان در NSCLC با رسم آنالیز منحنی ROC با مقدار 751/0 AUC= و 8676/0 AUC= به ترتیب برای ZMYND-8 و RAR-B2 تأیید شد. مطالعه اضافی بر روی نمونه¬های سرطانی در TCGA نشان داد که درجه متیلاسیون بالاتر RAR-B2 و درجه متیلاسیون کمتر ZMYND-8 یک تغییر شایع در تکامل تومور است که احتمالاً به عنوان یک نشانگر زیستی تشخیصی احتمالی برای سرطان ریه در نظر گرفته می شود.