بررسی سطح بیان LncRNA DLGAP1-AS2 در بافت هاي سرطان کولورکتال به عنوان بیومارکر تشخیصی
چکیده
سرطان کولورکتال به عنوان یکی از سرطان های رایج در سراسر جهان محسوب می شود. نقش lncRNA ها در ایجاد انواعی از سرطان به خصوص سرطان کولورکتال گزارش شده است. بنابراین، در این مطالعه سطح بیان lncRNA DLGAP1-AS2 در بافت های سرطان کولورکتال و سالم مجاور بررسی شد.
روش کار: در ابتدا بیان lncRNA DLGAP1-AS2 به صورت انفورماتیکی با استفاده از داده پایگاه اطلاعاتی TCGA در نمونه هاي سرطان کولورکتال نسب به نمونه هاي سالم مورد ارزیابی قرار گرفت. سپس تعداد 33 بافت سرطان کولورکتال و 33 نمونه بافت مجاور سالم از بیماران سرطان کولورکتال با رضایت کتبی گرفته شده و ویژگی کلینیکال و پاتولوژیک آن ها توسط پاتولوژیست تعیین و مشخص گردید. سپس RNA مربوط به نمونه ها استخراج و پس از بررسی وتایید کیفیت و غلظت آن ها، سنتز cDNA انجام شد. در ادامه با روش real-time PCR بیان lncRNA DLGAP1-AS2 درنمونه ها اندازه گیري و ارتباط آن با ویژگی هاي کلینیکال و پاتولوژیک بررسی شد. همچنین در نهایت محاسبات آماري جهت تعیین قدرت بیومارکري این lncRNA صورت گرفت.
یافته¬ها: نتایج حاصل از دیتاست¬های TCGA و نمونه¬های آزمایشگاهی نشان داد سطح بیان lncRNA DLGAP1-AS2 در نمونه های سرطان کولورکتال در مقایسه با نمونه های مجاور سالم به طور معناداری افزایش نشان می¬دهد. همچنین، نتایج حاصل از آنالیز منحنی ROC در نمونه¬های TCGA حاکی از قدرت بیومارکری این lncRNA بود.