تنوع ژنتیکی ایزوله های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس از بیماران مسلول در شمالغرب ایران با روش MIRU-VNTR طی سال های(98-95)
چکیده
مایکوباکتریوم توبرکلوزیس عامل بیماری سل) (TB می باشد که یکی از عوامل مرگ و میرناشی از بیماری های عفونی در سراسر جهان می باشد. به علت نهفته بودن عفونت سل، روش های کلاسیک نمی تواند شیوع بیماری را مشخص کند. امروزه روش های ژنوتایپینگ براساس توالی های تکراری تصادفی(VNTR) با استفاده از واحد های تکراری پراکنده مایکوباکتریایی(MIRU) وجود دارد که این روش بر مبنای PCR می باشد و تعداد تکرارهای هر لوکوس، براساس اندازه محصول PCR محاسبه می گردد.
مواد و روش ها : تعداد 120 ایزوله مایکوباکتریوم توبرکلوزیس از بیماران سل ریوی از مرکز سل استان تبریز جمع اوری گردید و به دلیل اینکه نمونه های جمع آوری شده در بازه زمانی سال 95 تا 97 منفی شدند و فاقد ژنوم DNA بوده اند در مطالعه خود مجبور به جمع آوری مجدد نمونه ها شده و مدت زمان جمع آوری مجدد نمونه ها از آذرماه 99 تا اردیبهشت ماه 1400 از مرکز بیماری سل استان تبریز انجام شد و در محیط اختصاصی کشت داده شدند و سپس با روش کلروفرم- CTAB استخراج شدند و بصورت ایزوله به آزمایشگاه میکروبی مرکز تحقیقات کاربردی دارویی انتقال یافتند. الگوی 15 لوکوس ژنتیکی MIRU ایزوله ها برای تعیین ژنوتایپینگ و ارتباط فیلوژنتیک آن ها با استفاده از روش PCR مورد ارزیابی قرار گرفت.
یافته ها : از 120 ایزوله مایکوباکتریوم توبرکلوزیس که از بیماران شامل (65%)78 مرد و (5/32 %)39 زن جمع آوری شده بودند DNA استخراج شد و به روش مولتی پلکس تکرار های رندوم مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج MIRU-VNTR نشان داد بیماران دارای 15 کلاستر و36 الگوی منحصر به فرد بودند که تعداد ایزوله ها در این کلاسترها به ترتیب شامل: 1 کلاستر با 7 عضو، 2 کلاستر با 5 عضو، 4 کلاستر با 3 عضو و8 کلاستر با 2 عضو می باشند و 15 کلاستر این مطالعه مشتمل بر 45 بیمار بود و تعداد بیماران مراجعه کننده از کشور آذربایجان در مطالعه ما 3 نفر(5/2%) بودند و همچنین میانگین سن بیماران 62 سال می باشد.