بررسی تأثیرات آفلاتوکسین B1 در بروز سرطان سلول‌های کبدی با استفاده از روش‌های محاسبات زیستی
چکیده
مقدمه: رشد بدخیم سلول‌های کبدی(HCC) یکی از شناخته‌شده ترین بدخیمی‌های اولیه کبدی در سراسر جهان می‌باشد شیوع آن در حال رسیدن به سطح هشدار بوده و به یکی از نگرانی‌های جهانی تبدیل شده است؛ لذا پیداکردن نشانگرهای زیستی که در اثر وجود آفلاتوکسین B1 در سرطان سلول‌های کبدی درصد ابتلا به بیماری را افزایش می‌دهد حائز اهمیت می‌باشد. ازاین‌رو به‌وسیله روش‌های محاسبات زیستی می‌توان مسیرهای سیگنالینگ و ژن‌های درگیر در این بیماری را به دست آورده و از این اطلاعات در جهت طراحی داروها و سایر روش‌های درمانی استفاده کرد. هدف: پیداکردن ماژول‌های ژنی که در مواجهه آفلاتوکسین B1 در بیماری سرطان سلول‌های کبدی موثر هستند و بررسی مسیرهای بیولوژیکی درگیر در این بیماری بعنوان هدف پژوهش تعریف شده است که می¬توان در جهت استفاده از مواد دارویی که از این مسیر ها ایجاد اثر می کنند بهره برد و عوارض دارویی را به حداقل ممکن رساند. روش کار: ژن‌هایی که از لحاظ آماری بیان معناداری نسبت به سایر ژن‌ها دارند مشخص می‌شوند در نهایت الگوریتم‌های آماری در استخراج ژن‌های معنی‌دار مؤثر به‌عنوان نشانگر زیستی برای بررسی تأثیرات آفلاتوکسین B1 و مسیرهای سیگنالینگ دخیل در بیماری سرطان سلول‌های کبدی (HCC) به کار می‌روند. نتایج: ژن‌هایی که در نهایت به‌عنوان مهم‌ترین ژن‌ها دسته‌بندی و استخراج شده‌اند با استناد به سایر مطالعات انجام‌گرفته در بیماری HCC مؤثر بوده و در بین گروه‌های مقایسه شده بیشترین تعداد ژن‌های متفاوت بیان شده مربوط به گروه شماره (2) با 718 ژن متفاوت بیان شده می‌باشد که باتوجه‌به عناوین ژن‌های مقایسه و بررسی شده قابل‌توجیه می‌باشد.
بحث: ژن‌هایی که در نهایت به‌عنوان تأثیرگذارترین ژن‌ها در هر گروه هستند، در سایر تحقیقات هم به لحاظ تأثیرگذاری در بیماری (HCC) اثبات گردیده‌اند و شبکه‌های ارتباطی پروتئین - پروتئین پیش‌بینی‌شده توسط محقق هم بین آن‌ها برقرار می‌باشد.