محاسبه شانون آنتروپی -به واحد پیت- در شبکه ی پروتئینی دخیل در رسوب آمیلوئید بتا
چکیده
در این پایان نامه، با استنتاجی آنتروپیک از شبکه های پروتئینی، بر آن شدیم که روشی جدید از تجزیه و تحلیل شبکه ها را ارائه دهیم. هدف ما شناسایی پروتئین های اصلی در پاتوژنز بیماری آلزایمر و اولویت بندی آنها در شبکه بیماری آلزایمر با استفاده از روش نوین ارائه شده بوده است.
روش کار: در این مطالعه، یک روش محاسباتی نوین مبتنی بر محاسبه سطح بی نظمی (آنتروپی شانون) برای تحلیل شبکه های پروتئینی با تاکید بر شبکه تجمیع آمیلوئید بتا، معرفی می گردد. تازگی روش ما در ارائه ی روشی برای تخمین میزان اطلاعات متقابل (mutual information) بین یک پروتئین و شبکه مربوطه اش می باشد، که تاکنون چنین برداشتی از شبکه پروتئین ها ارائه نشده است و مبحث اطلاعات متقابل صرفاً محدود به علم نظریه اطلاعات مانده است.
یافته ها: پس از مروری کامل بر متون، ۹۷ پروتئین را به عنوان پروتئین های اصلی در پاتوژنز بیماری آلزایمر گزارش کرده و دو معیار آنتروپی شانون و اطلاعات متقابل را برای تمامی آن ها محاسبه کردیم. نتایج به دست آمده از روش جدید ما با دانش معاصر در مورد بیماری آلزایمر هم راستا بوده و بیشتر بر اهمیت آمیلوئید بتا تأکید می کند. همچنین، نتایج حاصله اهمیت برخی از پروتئین های کمتر بررسی شده را روشن می کند.