آنالیز مولکولی جهش های شایع دراگزون های 9و8 ژن TP53 درمبتلایان به بیماری سرطان سلولهای سنگفرشی ریه(SCC ) با یا بدون آلودگی به HPV

Abstract

The aim of this study was to investigate the prevalence of HPV and TP53 mutations in squamous cell carcinoma (SCC) of the lung in patients in the northwestern Iran. Method: 50 paraffin blocks of lung SCC search for HPV DNA by Nested-PCR for HPV typing is selected and their DNA was sequenced. Same number of positive and negative samples for the presence of HPV DNA by PCR and direct sequencing of TP53 gene mutations in exons 8 and 9 were examined. Results: Out of 50 evaluated samples, 9 samples (18%) had HPV DNA that 8 of them were HPV-18 and one of them was HPV-6. The mutations of TP53 were observed in 6 cases that 5 of them were in the exon 9 and one of them was in exon 8. The nucleotide changes in 4 cases were (c.14034A> AG), in one case was (c.14063C> CT), and in one case was (c.13841G> GA). Anticipated changes in mentioned cases were K321R, Q331X and the E287E respectively. Of 6 listed samples, in 4 cases mutations in the TP53 was c.14034A> AG, that HPV-18 was found in 2 of them and 2 cases were normal in this regard. While the other 2 remaining mutants, both were found in the samples which were HPV DNA-positive., هدف از مطالعه حاضر بررسی فراوانی گونه های HPV و جهش های ژن TP35 در کارسینوم سلول سنگفرشی ریه در بیماران شمال غربی ایران است.مواد و روش ها: از 30 بلوک پارافینی اسکواموس سل کارسینوما ) SCC ( ریه با روشNested-PCR ، HPV DNA استخراج شده و سپس جهت HPV تایپینگ توالی یابی گردید.تعداد یکسانی از نمونه های مثبت و منفی HPV با روش PCR و توالی یابی مستقیم جهت1 ژن - وجود جهش در اگزون های 1 TP35 بررسی شدند.91 %( مورد برای ( نتایج: از 30 نمونه مورد بررسی، 1 HPV مثبت بودند که بعد از توالی یابی- 1 مورد آن تایپ 91 HPV - و یک مورد تایپ 6 HPV بودند. در بررسی جهش های ژن TP ، 35تغییرات در 6 مورد مشاهده شد که در 3 مورد در اگزون شماره 1 و در یک مورد در اگزون‌شماره 1 قرار داشتند. تغییرات نوکلئوتیدی در 4 مورد به صورت ) c.94054A>AG (، در یک مورد ) c.94065C>CT ( و در یک مورد به صورت ) c.95149G>GA ( بود که به ترتیب به‌صورت K529R ، Q559X و E21.E بودند. از 6 مورد ذکر شده، در 4 مورد جهش در ژنTP35 به صورت c.94054A>AG بود که در 2 مورد تایپ HPV-91 یافت شد و 2 مورد از این‌نظر نرمال بودند. در حالی که در دو جهش باقی مانده، هر دو فقط در نمونه های با HPV مثبتیافت شدند