Theses(P)

Permanent URI for this collectionhttps://dspace.tbzmed.ac.ir/handle/123456789/6

Browse

Now showing 1 - 4 of 4

Investigating the genetic diversity of aquatic bacteria of lake urmia in estuary of jighati (zarrine rood) and tatao (simine rood) rivers in the fall of 1400(2021)
(Tabriz University of Medical Sciences, School of Pharmacy, 2024) Khalafi, Armin; Mehdizadeh Aghdam, Elnaz; Tarhriz, Vahide; Hejazi, Mohammad Saeid; Montazersaheb, Soheila
Introduction: Lake Urmia is one of the saltiest lakes in the world, which faces the risk of dryness and excessive salinity. Aquatic microorganisms play an important role in the decomposition of substances, food chains and biochemical cycles and can also have functional effects. Therefore, the isolation and identification of bacteria is very necessary to better understand their function in an ecosystem like Urmia Lake, which is constantly changing.Objectives: The objectives of this study are to isolate and purify the bacteria in the water collected from the river mouth of Zarinerood and Siminerood rivers, and then to determine the 16sRNA sequence of the isolated bacteria to determine the identity of the bacteria and also to investigate the biochemical properties of gram, catalase, oxidase, and and motility of bacteria.Methodology: The population of bacteria was cultured in the form of single colonies during the growth process and successive isolations. After the DNA extraction stage and if the quality of the results of qualitative and quantitative investigation was suitable, the selected bacteria were sent for sequencing and also phenotypic tests were performed on the isolated bacteria.Findings: In this study, bacteria isolated from Lake Urmia were isolated, and finally 9 bacterial isolates were subjected to phenotypic studies. According to the results, the majority of these bacteria were gram positive, catalase positive, KOH negative, oxidase positive and amylase negative. DNA extracted from these bacteria was sent to determine the sequence of 16srRNA. The results of this study indicate the possibility of reducing the types of bacteria in this place.conclusion: According to the obtained results, the phenotypic results also do not show much diversity among the selected species and there is a possibility of reducing the bacterial species in this place.
Isolation and Characterization of aquatic Bacteria of Quri-Gol lake in 2021
(Tabriz University of Medical Sciences, School of Pharmacy, 2024) Shahin Doost, Amin; Hejazi, Mohammad saeid; Montazersaheb, Soheila; Mehdizadeh Aghdam, Elnaz; Tarhriz, Vahideh
Qurigol is one of the most important wetlands in East Azarbaijan province in terms of non-pathogenic bacterial population. To identify beneficial microorganisms, we referred to Qurigol place to collect, isolate and characterize the bacterial populations.Objectives: The objectives of this research were to isolate the bacteria present in Qurigol and then determine their identity with respect to related species and to investigate phenotypes such as gram, oxidase,Methodology: During the isolation process, the bacteria were cultured as single colonies separated from each other. Finally, after passing through the DNA extraction stage, phenotypic examination including gram test, oxidase, urease, catalase and motility was examined.Results: In this study, the bacteria isolated from the Qurigol pond were isolated and phenotypically investigated. After DNA isolation and extraction, 7 isolates were sent for 16srRNA sequencing due to having suitable optical absorption and the results of phenotypic tests were also reported. According to the results, the majority of these bacteria were gram positive, catalase positive, KOH negative, oxidase positive and amylase negative. Conclusion: Observing the state of the Qurigol showed that the dryness of the environment has damaged the normal flora, and the same can be concluded from the findings. We hope that in the coming years more importance will be given to valuable resources and measures will be taken to recover the area.
بررسی تنوع ژنتیکی باکتری های آبزی دریاچه ارومیه در مصب رود های جیغاتی (زرینه رود) و تاتائو(سیمینه رود) در پاییز سال 1400(2021 میلادی)
(دانشگاه علوم پزشکی تبریز، دانشکده داروسازی, 1403) خلفی, آرمین; مهدیزاده اقدم, الناز; طرح ریز, وحیده; حجازی, محمد سعید; منتظرصاحب, سهیلا
مقدمه: دریاچه ارومیه یکی ازشورترین دریاچه های دائمی جهان است که با خطر خشکی و شوری بیش از اندازه مواجه است. میکروارگانیسم های آبزی نقش مهمی در تجزیه مواد، زنجیره های غذایی و چرخه های بیوشیمیایی دارند و همچنین می توانند اثرات کاربردی داشته باشند. بنابراین جداسازی و شناسایی باکتری ها برای درک بهتر عملکردشان در اکوسیستمی مانند دریاچه ارومیه که مدام در حال تغییر می باشد بسیار ضروری است.اهداف: اهداف این مطالعه جداسازی و خالص سازی باکتری های موجود در آب جمع آوری شده از مصب رودهای زرینه رود و سیمینه رود و سپس تعیین توالی 16sRNA باکتری های ایزوله شده جهت تعیین هویت باکتری و همچنین بررسی خواص بیوشیمیایی گرم، کاتالاز، اکسیداز، اوره آز و موتیلیتی باکتری ها بود.روش کار: جمعیت باکتری های گفته شده طی پروسه رشد و ایزولاسیون های پی در پی به صورت تک کلنی های جدا کشت داده شدند. پس از مرحله استخراج DNA و در صورت مناسب بودن کیفیت نتایج بررسی کیفی و کمی، باکتری های انتخاب شده برای توالی سنجی ارسال شدند و همچنین تست های فنوتیپی بر روی باکتری ای جداسازی شده انجام گرفت. يافته ها: در این مطالعه باکتری های جداسازی سازی شده از دریاچه ارومیه مورد ایزولاسیون قرار گرفتند که نهایتا 9 ایزولیه باکتریایی مورد بررسی های فنوتیپی قرار گرفت. طبق نتایج به دست آمده اکثریت این باکتری های گرم مثبت ، کاتالاز مثبت، KOH منفی ، اکسیداز مثبت و آمیلاز منفی بودند. DNA استخراج شده از این باکتری ها جهت تعیین توالی 16srRNA ارسال شد. نتایج حاصل از این مطالعه نشان دهنده احتمال کاهش انواع باکتریایی در این محل می باشد.نتيجه گيری:با توجه به نتایج به دست آمده نتایج فنوتیپی نیز تنوع زیادی در بین گونه های انتخاب شده را نشان نمیدهند و احتمال کاهش گونه های باکتریایی در این محل وجود دارد.
جداسازی و تعیین هویت باکتری های آبزی تالاب قوری گل در سال 1400 (2021 میلادی)
(دانشگاه علوم پزشکی تبریز، دانشکده داروسازی, 1403) شاهین دوست, امین; حجازی, محمد سعید; منتظرصاحب, سهیلا; مهدیزاده اقدم, الناز; طرح ریز, وحیده
مقدمه: تالاب قوری گل یکی از مهم ترین تالاب های استان آذربایجان شرقی از لحاظ جمعیت باکتریایی غیر بیماریزا می باشد.. برای شناسایی میکروارگانیسم های مفید می توان به محل هایی از جمله تالاب قوری گل رجوع کرد. اهداف:اهداف این تحقیق جداسازی باکتری های موجود در تالاب قوری گل و سپس تعیین توالی ‏16 S rRNA‏ جهت تعیین ‏هویتشان نسبت به گونه های نزدیک و بررسی فنوتیپی مانند گرم، اکسیداز، KOH، کاتالاز و آمیلاز بود. روش کار: باکتری ها طی پروسه ایزولاسیون به صورت تک کلونی های جدا از هم کشت داده شده درنهایت پس از گذشتن از مرحله استخراج DNA ، بررسی فنوتیپی شامل تست گرم، اکسیداز، اوره آز، کاتالاز و motility بررسی شد. يافته ها: در این مطالعه باکتری های جداسازی سازی شده از تالاب قوری گل مورد ایزولاسیون و بررسی های فنوتیپی قرار گرفت. پس از ایزولاسیون و استخراج DNA، 7 ایزوله باتوجه به داشتن جذب نوری مناسب برای تعیین توالی 16srRNA ارسال شدند و نتیجه تست های فنوتیپی نیز گزارش شد. طبق نتایج به دست آمده اکثریت این باکتری های گرم مثبت ، کاتالاز مثبت، KOH منفی ، اکسیداز مثبت و آمیلاز منفی بودند. DNA استخراج شده از این باکتری ها جهت تعیین توالی 16srRNA ارسال شد.نتيجه گيري: مشاهده وضعیت قوری گل نشان می دهد که خشکی محیط باعث آسیب فلور نرمال شده است که از یافته ها نیز همین مورد نتیجه گیری می‌شود. امیدواریم در سال های آتی اهمیت بیشتری به منابع باارزش داده شده و اقداماتی جهت احیای این سرمایه ی ملی انجام شود.