بررسی میزان بیان ژن‌های مرتبط با سیستم ایمنی IL17C، TEK و CCL4 برگرفته از آنالیز شبکه‌ هم‌بیان ژنی وزن‌دار در بیماری آلزایمر

Abstract

بیماری آلزایمر شایع‌ترین بیماری پیشرونده عصبی است که شیوع آن در سطح جهان رو به افزایش است. تاکنون مطالعات زيادی در جهت تنظیم بیان ژن‌های عملكردی التهابي انجام شده است و بیانگر اين نكته هستند که تغییری کوچک در نهايت می‌تواند سیستم عصبي مرکزی را متحمل تغییرات بیماری‌زايي کند. ژن‌های IL17C، TEK وCCL4 از جمله ژن‌های دخیل در مسیر های ایمنی و التهاب هستند که در این مطالعه با روش ‌های بیوانفورماتیکی و تجربی به بررسی تغییرات سطح بیان آن‌ها در خون محیطی و ارتباط آن‌ها با بیماری آلزایمر می‌پردازیم. مواد و روش ها: با استفاده از داده ‌های دیتاست ریز آرایه‌ی E-MTAB-6094 و آنالیز شبکه هم‌بیانی وزن‌دار سه ژن IL17C، TEK وCCL4 جهت بررسی تغییرات بیان در بیماری آلزایمر انتخاب شدند. از خون محیطی 50 فرد مبتلا به آلزایمر و 50 فرد سالم RNA تام استخراج شد و تغییرات بیان این ژن‌ها با استفاده از تکنیک Real-time PCR اندازه‌گیری گردید. در ادامه آنالیز های آماری اختلاف میزان بیان و بیومارکری روی داده‌ های حاصل انجام گرفت. یافته ها: میزان بیان ژن‌ IL17C به‌صورت معناداری در افراد مبتلا به آلزایمر نسبت به گروه کنترل کاهش نشان داد. در مقابل میزان بیان ژن‌ های TEK و CCL4 به‌صورت معنادار در گروه بیماران افزایش نشان داد. باتوجه به آنالیز های غنی‌سازی این ژن‌ها با مسیرهای ایمنی و التهابی در ارتباط هستند.