بررسی تغییرات متیلاسیون در پروموتور ژن هایSHOX2 وFTH1 در بافت توموری و مارژین در مبتلایان به سرطان ریه
Abstract
سرطان ریه به دلیل تشخیص دیرهنگام به عنوان یکی از کشنده ترین کارسینوم ها در دنیا شناخته می¬شود. یکی از تغییرات اساسی، متیلاسیون DNA است که به عنوان یکی از تغییرات اولیه رشد تومور است که یکی از شاخص های مهم برای تشخیص سرطان است. در واقع، متیلاسیون نابجای DNA یکی از شایع ترین و اولیه ترین علل تبدیل شدن به سلول های بدخیم از جمله سرطان ریه است.DNA ی متیله سلول های سرطانی در خون بیماران سرطانی یافت شده است، که نشان می دهد DNA در گردش خون یک نشانگرDNA ی مرتبط با تومور است که می تواند به عنوان یک تست تشخیصی کم تهاجمی استفاده شود. در این مطالعه، متیلاسیون ژنهای SHOX2 و FTH1 در NSCLC را به عنوان ابزار اپی ژنتیک جدید بررسی کردیم.
روش ﻛﺎر: برای شروع، به منظور یافتن قابلیت تشخیصی بالقوه متیلاسیون ژن های SHOX2 وFTH1، ما به طور کامل ریزآرایه های متیلاسیون DNA را از داده های اطلس ژنوم سرطان (TCGA) نمونه های NSCLC جستجو کردیم. علاوه بر این، ما با از استفاده از q-MSP در تعدادی از نمونههای شامل تومورهای NSCLC و بافتهای سالم حاشیه، میزان متیلاسیون ژنهای SHOX2و FTH1 استفاده کردیم.
نتایج: نتایج بهدستآمده از TCGA وq-MSP، هیپومتیلاسیون FTH-1 و هایپرمتیلاسیون SHXO2 را در بافتهای NSCLC در مقایسه با نمونههای حاشیه نشان داد. همچنین سطوح متیلاسیون FTH-1 و SHXO2 با مرحله بالینی بدخیمی ارتباط معنیداری داشت. علاوه بر این، تجزیه و تحلیل منحنی ROC مقادیر AUC را برای FTH-1 و SHXO2 به ترتیب برابر با و 8676/0 و 751/0تخمین زد، که نشانگر اهمیت آنها به عنوان نشانگرهای زیستی تشخیصی برای NSCLC است.