بررسی بیان ژن LNCRNA ی LINC01133 در بافت توموری و حاشیه تومور بدخیم تیروئید
چکیده
سرطان تیروئید به عنوان رایج ترین سرطان های مربوط به غدد درون ریز در سراسر جهان به خصوص در میان زنان محسوب می شود. نقش انواعی از Non-coding RNA ها از جمله lncRNA ها در ایجاد انواعی از بیماری ها به خصوص سرطان گزارش شده است. با توجه به نقش برجسته¬ی LINC01133 در سایر بدخیمی¬های مربوط به انسان، هدف از این مطالعه بررسی میزان بیان ژن LINC01133 در بافت های سرطانی و سالم تیروئید با هدف تشخیصی و درمانی می باشد.
روش کار: در ابتدا تعداد 25 بافت سرطان تیروئید و 25 نمونه بافت مجاور سالم از بیماران سرطان تیروئید با رضایت کتبی گرفته شد.همچنین، ویژگی های کلینیکال و پاتولوژیک آن ها توسط پاتولوژیست تعیین و مشخص گردید. RNA مربوط به نمونه ها استخراج شده و پس از بررسی و تایید کیفیت و غلظت آن ها، سنتز cDNA صورت گرفت. در ادامه با روش Real-time PCR بیان LINC01133 در نمونه ها اندازه گیري و ارتباط آن با ویژگی هاي کلینیکال و پاتولوژیک بررسی شد. همچنین، بیان LINC01133 به صورت بیوانفورماتیکی با استفاده از داده پایگاه اطلاعاتی TCGA در نمونه هاي سرطان تیروئید نسبت به نمونه های سالم مورد ارزیابی قرار گرفت. در نهایت محاسبات آماري جهت تعیین قدرت بیومارکري این lncRNA انجام شد.
یافته ها: نتایج حاصل از مطالعه نشان داد که میزان بیان ژن LINC01133 به طور معناداری در نمونه¬های سرطان تیروئید در نمونه¬های آزمایشگاهی و نمونه¬های TCGA دچار کاهش می¬گردد. آنالیز منحنی ROC حاکی از قدر بالای بیومارکری پروفایل بیانی LINC01133 در نمونه¬های سرطان تیروئید بود. همچنین بررسی انفورماتیکی بیشتر نشان داد که LINC01133 در فرآیندهایی همچون سازماندهی ماتریکس خارج سلولی می¬تواند نقش ایفا بکند.