بررسی بیان ژن P38 و متیلاسین پروموتور این ژن در نمونه های توموری و مارژین بیماران مبتلا به سرطان سینه پستان
Abstract
با توجه به لزوم شناسایی بیومارکرهای تومورزایی و به دنبال آن پیشبینی سیر احتمالی سرطان پستان، در مطالعه حاضر، ما به دنبال بررسی تفاوتهای بالقوه در بیان و متیلاسیون پروموتر پروتئین کیناز 1 فعال شده با میتوژن (MAPK1) بین سلول های تومورال و سلولهای مارژینال بافت سرطان پستان هستیم.
روش کار و مواد: 50 بیمار مبتلا به سرطان پستان (BCa) به طور تصادفی انتخاب شده و تحت بیوپسی سوزن قرار گرفتند. نمونه های بالینی حاوی سلول های تومورال و مارژینال جمع آوری شده، پس از استخراج DNA با استفاده از آغازگرهای خاص ، میزان MAPK1 mRNA و متیلاسیون پروموتر با اسپکتروفتومتری با داده های برنامه ATLAS ژنوم سرطان (TCGA) در مورد آدنوکارسینوما معده (STAD) مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. مناسب بودن بیان MAPK1 و متیلاسیون پروموتر به عنوان نشانگرهای زیستی برای BCa با منحنی های مشخصه عملکرد گیرنده (ROC) مورد بررسی قرار گرفت.
یافته ها: براساس یافته های این مطالعه، بین استیج تومور و بیان MAPK1 در BCa ارتباط مثبتی وجود دارد ( 029/0P: ). همچنین بیان MAPK1 به طور قابل توجهی با متاستاز غدد لنفاوی همراه است (018/0P: ). در بیان ژن MAPK1 بین سلول های تومورال و مارژینال BCa و STAD تفاوت معنی داری وجود دارد (P-Value <0.001). با این حال ، تفاوت معنی داری در متیلاسیون پروموتر MAPK1 بین این 2 نوع سلول یافت نشد. با داشتن ناحیه ای در زیر منحنی (AUC) 71/0 ، دقت تشخیصی بیان MAPK1 در BCa و STAD تأیید شد. با این حال ، متیلاسیون پروموتور MAPK1 به عنوان یک نشانگر مناسب شناخته نشد.