بررسی بیان lncRNA RBPMS-AS1 در بافت های سالم و سرطان تیروئید به عنوان هدف تشخیصی و درمانی

Abstract

سرطان پاپیلاری تیروئید (PTC)، به عنوان شایع ترین بدخیمی غدد درون ریز، حدود 85 درصد از کل موارد سرطان تیروئید را شامل می گردد. جراحی به عنوان درمان اولیه برای این بیماری به شمار می رود. با این حال، میزان بروز جهانی آن به سرعت در حال افزایش است. در سال‌های اخیر، مطالعات نشان داده‌اند که بیان ژن نامناسب به دلیل بی‌ثباتی ژنومی یا تغییرات نشانگر اپی ژنتیکی، نقش عمده‌ای در تنظیم PTC دارد. LncRNA ها با طولی بيش از 200 نوکلئوتيد، بخشی از فراورده هاي بيان ژن هستند که به پروتئین ترجمه نمی شوند. عملکرد این ملکولها وابسته به ساختار مولکولي منحصر به فرد آن ها بوده، و از این طریق نقش مهمي در تعدیل انکوژن های متنوع و ژن های سرکوبگر دارند. بر طبق گزارشات، تعداد زیادی از lncRNA ها از قبیل RBPMS-AS1 غالبا در سرطان‌های مختلف از تنظیم خارج می شوند. این lncRNA نقش قابل توجهی را در تکثیر، مهاجرت و EMT سرطان¬ها نشان داده است. روش کار : بنابراین، در این مطالعه، میزان بیان RBPMS-AS1 در نمونه های بافتی و بیوانفورماتیکی جهت بررسی نقش آن در شروع و پیشرفت سرطان تیروئید با هدف بیومارکری مورد بررسی قرار گرفت. ابتدا تعداد 20 نمونه بافت سرطان تیروئید و 20 نمونه بافت مجاور سالم از بیماران گرفته شد. سپس RNA از نمونه ها استخراج گردیده و سنتز cDNA صورت گرفت. سپس با استفاده از qPCR بیان RBPMS-AS1 در نمونه ها اندازه گیری و ارتباط آن با ویژگی های کلینیکال و پاتولوژیک بررسی شد. همچنین برای تایید نتایج به دست آمده، بیان ژن به صورت انفورماتیکی با استفاده از داده پایگاه اطلاعاتی TCGA در نمونه های سرطانی نسبت به نمونه های سالم مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین قدرت تشخیصی این مارکر با استفاده از آنالیز منحنی ROC و نیز ارتباط آن با زنده مانی بیماران با روش Kaplan- Meier مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته ها : نتایج نشان داد میزان بیان RBPMS-AS1 به طور معناداری در نمونه های سرطانی در مقایسه با نمونه های سالم کاهش یافته است و این نتایج از طریق داده پایگاه اطلاعاتی TCGA مورد تایید قرار گرفت. همچنین آنالیزهای بیشتر بر روی دیتاهای TCGA حاکی از ارتباط منفی و معنادار بیان RBPMS-AS1 با استیج سرطان و میزان بقای بیماران مبتلا به تیروئید در مراحل نهایی می باشد. به علاوه، آنالیز منحنی ROC نشان داد که نتیجه گیری : الگوی بیان این ژن می تواند به عنوان بیومارکر بالقوه ی تشخیصی برای سرطان تیروئید در نظر گرفته شود. بنابراین، این مطالعه اهمیت این lncRNA را در ایجاد و پیشرفت سرطان تیروئید نشان می دهد.