تعیین بررسی میزان بیان ژن های رترو-ویروسی اندوژن انسانی در بدخیمی های معده و حاشیه نرمال تومور
چکیده
سرطان معده پنجمین سرطان شایع در سراسر جهان و دومین علت مرگ و میر است. بیومارکر های متفاوتی در سرطان ها برای تشخیص زودرس آن پیشنهاد شده اند، چندین خانواده ی مهم از رتروویروس های اندوژنوس در ژنوم انسان وجود دارد و کاربرد آنها در تحقیقات سرطان رو به افزایش است. این مطالعه با هدف بررسی میزان بیان ژن های رتروویروسی اندوژن انسانی در بدخیمی های معده انجام شد.
روش کار: از بیماران مراجعه کننده با مشکلات گوارشی ارجاع شده برای اندوسکوپی بعد از کسب رضایت نامه نمونه های بافتی مشکوک به سرطان معده از ناحیه مورد نظر و حاشیه نرمال اخذ شد. نمونه های جمع آوری شده بلافاصله در تانک نیتروژن قرار داده و برای استفاده بعدی به فریزر منفی 70 انتقال داده شد. پرسشنامه ای حاوی اطلاعات بیمار که حاوی سابقه ی بیماری قبلی ، مصرف دارو، سبک زندگی و میکرو ریسک فاکتور ها است تکمیل گردید . بعد از دریافت پاسخ پاتولوژی و تایید سرطان در بافت مورد نظر با استفاده از محلول ترایزول تجاری RNA استخراج و سنتز cDNA را بلافاصله برای حفظ کیفیت نمونه ها انجام داده شد. برای توالی های هدف اقدام به طراحی پرایمر اختصاصی نموده و سپس با استفاده از پرایمرهای اختصاصی HERV های مورد نظر را با استفاده از quantitative PCR تکثیر نموده و نتایج به دست آمده را بعد از نرمالایز کردن با ژن رفرانس ( ژن GAPDH) با مشورت مشاور آماری آنالیز کرده و جواب نهایی گزارش گردید.
یافته ها : در این مطالعه از 40 بیمار مورد بررسی، بیشتر بیماران سن کمتر از۶۵ سال داشتند و مرد بودند. بدخیمی نوع Intestinal بالاترین فراوانی را داشت. نیمی از توده ها سایز بزرگتر یا مساوی 5 سانتی متر داشتند. 60 % متاستاز به لنف نود و 5/57 % متاستاز دوردست داشتند. میانگین میزان بیان HERV-E و HERV-K در بافت تومور نسبت به حاشیه تومور اختلاف آماری معنی داری را نشان داد. میزان بیان HERV-E در بافت حاشیه تومور با سن و جنس ارتباط آماری معنی داری داشت. تحلیل رگرسیون لجستیک ترتیبی (ordinal logistic regression) جهت بررسی پیشگویی کنندگی ژنهای HERK در هیسترولوژی معنی دار بود.