مطالعه رابطه کمي ساختمان فعاليت مشتقات پلي فنولي مهار کننده پي گليکوپروتئين
چکیده
پي گليکو پروتئين P-gp)) يکي از پروتئين هاي غشاي پلاسمايي مي باشدکه مي تواند با بيرون انداختن داروها به خارج از سلول منجر به مقاومت دارويي شود. بنابراين طراحي ترکيباتی که بتوانند P-gp را مهارکنند ،مي تواند گام مهمي در کاهش به مقاومت دارويي باشد.
اهداف:
ارائه مدل کمي ساختمان –فعاليت توسط توصيف گرهاي نرم افزار دراگون و روش آناليز تصويري براي پيش بيني فعاليت مشتقات پلي فنولي مهار کننده ي P-gp مي باشد.
روش کار:
ساختمان دو بعدي و فعاليت مهار کنندگي P-gp ترکيبات از مقاله جمع آوري شد.توصيف گرهاي مولکولي توسط نرم افزار دراگون محاسبه شدند. پيکسل تصاوير و مولفه هاي اصلي (PCs)توسط نرم افزار MATLABمحاسبه گرديد. بهترين توصيف گرهاي مولکولي و PC ها توسط رگرسيون مرحله اي انتخاب شدند و با استفاده از روش هاي نحليل مولفه هاي اصلي(PCR)، رگرسيون خطي چند متغييره (MLR).شبکه ي عصبي مصنوعي (ANN) و ماشين بردار پشتيبان (SVM) مدل هاي خطي و غير خطي ارائه شد. جهت اعتبار بخشي به مدل هاي ارائه شده، معتبرسازي داخلي و خارجي انجام شد.
نتايج:
5 توصيف گر مولکولي نرم افزار دراگون و 6 مولفه اصلي روش آناليز تصويري حاصل از روش آماري رگرسيون مرحله اي جهت ارائه ي مدل خطي و غير خطي استفاده شدند. بهترين مدل هاي ارائه شده شامل:ANN با ضريب همبستگي0.80 براي گروه تست مدل QSAR توسط توصيف گرهاي نرم افزار دراگون و SVM با ضريب 0.94 براي گروه تست مدل QSARتوسط روش آناليز تصويري.
بحث :
مدل هايQSAR ارائه شده مي توانند فعالت ترکيبات مهارکنندگي p-gp را با دقت خوب پيش بيني کنند. مدل هاي غير خطي و روش هاي منطقي انتخاب دسته ي تست و آموزش بهترين نتايج را نشان دادند.
نتايج نشان مي دهد که روش آناليز تصويري يک روش سريع براي پيش بيني فعاليت ترکيبات شبه دارويي بدون نياز به نرم افزارهاي تجاري می باشد