شناسایی پپتیدهای متصل شونده به گیرنده تیروزین کینازی RON با روش نمایش فاژی و مدل بندی مولکولی نحوه اتصال آنها

Abstract

مقدمه: تلاش های اخیر برای مبارزه با سرطان، روی درمان های هدفمند مولکولی تمرکز یافته وگیرنده RONنظرات زیادی را به عنوان یک هدف امیدبخش برای درمان سرطان به خود جلب کرده است. اهداف: 1) شناسایی پپتید های متصل شونده به گیرنده RON با استفاده از روش نمایش فاژی 2) مطالعه نحوه برهمکنش بین گیرنده RON و پپتید های شناسایی شده 3) شناسایی هات اسپات های کمپلکس RON-MSPبا روش محاسباتی جهش زایی آلانین اسکنینگ. روشها: ابتدا یک کتابخانه فاژ پپتیدی 12 تایی برای انجام غربالگری زیستی بر علیه گیرنده RON استفاده گردید. توانایی پپتیدهای شناسایی شده و مکان احتمالی اتصال آنها، با روش الایزا مورد ارزیابی قرار گرفت. نحوه اتصال پپتیدها و تمایل آنها با روش های محاسباتی پیش بینی شد. همچنین اسیدهای آمینه مهم در اتصال RON باMSP با روش آلانین اسکنینگ شناسایی شدند. یافته ها: نتایج الایزا نشان داد فاژP6 در مقایسه با بقیه فاژها تمایل بیشتری به RON دارد و جایگاه اتصال آن خارج از محل لیگاند می باشد. نتایج داکینگ و دینامیک مولکولی، تمایل بیشتر پپتید P6 و جایگاه اتصال خارج از جایگاه لیگاندی را تایید کرد. همچنین نتایج نشان داد جهش Gln193, Arg220, Glu287, Pro288, Glu289, His424از گیرندهRON به آلانین موجب نامناسب شدن انرژی اتصال به MSP می گردد و در مورد Arg521, His528, Ser565, Glu658, Arg683 از MSP نیز چنین نتیجه ای بدست آمد که نشان دهنده اهمیت این اسیدهای آمینه در اتصال می باشد. نتیجه گیری: داده های ما توانایی پپتید P6 با توالی FEHSLYKEMTHL را به عنوان یک عامل متصل شونده به RON نشان داد و بنابراین پپتید P6 میتواند به منظور اهداف مختلفی مانند طراحی سیستمهای دارورسانی به سلولهای سرطانی، ایجاد اختلال در سیگنالینگRON، طراحی داروهای مقلد پپتیدی و تصویر برداری تشخیصی مورد استفاده قرار گیرد. همچنین شناسایی هات اسپات های RON وMSP باعث جهت دهی پروسه طراحی منطقی دارو به منظور توسعه عوامل خنثی کننده RON و MSP می گردد.