بررسی بیومارکر P16INK4a در تشخیص تغییرات دیسپلاستیک سرویکس به روش ایمونوهیستوشیمی
Abstract
باکتری های نمک دوست در طیف گسترده ای از غلظت نمک رشد می کنند که بر اساس طبقه بندی کوشنر باکتری های نمک دوست به سه گروه باکتری های تحمل کننده نمک ، باکتری های نمک دوست معتدل و باکتری های نمک دوست افراطی تقسیم می شوند. باکتری های نمک دوست توانایی تولید آنزیم های مختلفی همچون آمیلاز، لیپاز و پکتیناز را دارند که در صنعت ارزشمند هستند.
هدف:
هدف از این پژوهش جداسازی باکتری های نمک دوست تولید کننده آنزیم های آمیلاز، لیپاز و پکتیناز از خاکهای نمکی مرکز ایران است و همچنین بررسی نواحی محافظت شده سکانس پروتئینی این آنزیم ها برای طراحی پرایمر با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیک است.
مواد و روش کار:
در این پژوهش در ابتدا باکتری های نمکدوست جداسازی شده از خاکهای نمکی مرکز ایران در محیط مخصوص باکتری های نمکدوست کشت داده شود، سپس باکتری های جداسازی شده برای تولید آنزیم های هیدرولایتیک آمیلاز، لیپاز و پکتیناز مورد بررسی قرار گرفتند. سپس باکتری ها نمک دوست تولید کننده آنزیم های هیدرولایتیک با استفاده از روش 16srRNA شناسایی شدند. در ادامه سکانس های محافظت شده پروتئینی آنزیم های هیدرولایتیک برای طراحی پرایمر با استفاده از نرم افزارهای بیوانفورماتیک مورد بررسی قرار گرفتند.
نتایج:
نتایج نشان داد که باکتری های نمکدوست جداسازی شده از خاک های نمکی مرکز ایران توانایی تولید آنزیم های هیدرولایتیک را دارند که باکتری های نمک دوست تولید کننده آنزیم های آمیلاز و پکتیناز متعلق به جنس های Bacillus و Halobacillus و باکتری های تولید کننده لیپاز متعلق به جنس های Virgibacillus و Bacillus بودند. همچنین نتایج بررسی سکانس های پروتئینی آنزیم ها نشان داد سکانس پروتئینی محافظت شده آنزیم های هر جنس با جنس باکتریایی دیگر متفاوت است و نیاز به طراحی پرایمر برای آنزیم های هیدولایتیک به صورت جداگانه برای هر جنس باکتری های نمکدوست جداشده دارد.