واکاوی وضعیت متیلاسیون پروموتر ژن های KISS1 و EDNRB در نمونه های تومور و نرمال کناری سرطان کولون و راست روده تک گیر

Abstract

هدف از این مطالعه، واکاوی وضعیت متیلاسیون پروموتر ژن های KISS1 و EDNRB در نمونه های تومور و نرمال کناری سرطان کولون و راست روده تک گیر می باشد. در مطالعه حاضر،بعد از استخراج DNAاز 45 جفت نمونه بافت CRCتک گیر و حاشیه غیر سرطانی¬شان و تیمار آنها با کیت بی سولفیت، وضعیت متیلاسیون نواحی غنی از CpGژن-های KISS1و EDNRB از لحاظ نیمه-کمی توسط روش MS-HRMبا هدف تعیین کاربردی بودن این انحراف متیلاسیون ها برای تشخیص CRC تک گیر و افتراق آن از بافت¬های سالم مرتبط، ارزیابی شد. نتایج نشان داد که توزیع متفاوت متیلاسیون در همه جایگاه انتخاب شده در درون پروموتر ژن EDNRBدر مقایسه¬ی بافت¬های توموری با حاشیه غیر سرطانی¬شان از لحاظ آماری معنی دار بود (p 0.001)؛آنها همچنین بعضی همبستگی¬هایی با مرحله و درجه تومور داشتند. علیرغم این، توزیع متیلاسیون در نواحی غنی از CpGژن KISS1، تفاوت معنی¬داری را از لحاظ آماری بین CRC و بافت¬های غیر سرطانی کناری، نشان نداد (p= 0.060)., Cancers are among the most serious threats of human health worldwide. Survival and mortality rates of colorectal cancer (CRC) strongly depend on the early diagnosis. The aberrant methylation pattern of genes as a diagnostic biomarker can serve as a practical option for timely detection and contribute subsequently to the enhancement of survival rate in CRC patients, since methylation changes are not only frequent but also can occur in initial tumorogenesis stages. It has been indicated that EDNRB and KISS1 genes are hypermethylated through progression and development of CRC.In current study, after extraction of genomic DNA from 45 paired tumor and adjacent non-cancerous tissue samples and treatment with bisulfite conversion, the methylation status of EDNRB and KISS1 CpG rich regions were assessed quantitatively using MS-HRM assay in order to determine practicability of these aberrant methylations for diagnosis of sporadic CRC and its discrimination from corresponding normal tissues.The results showed that the methylation distribution differences, comparing tumor tissues with their adjacent non-cancerous tissues, were statistically significant in all selected locations within EDNRB gene promoter (p 0.001); they had also some correlations with tumor stage and grade. Nonetheless, methylation distribution in KISS1 gene CpG rich region revealed no statistically significant differences between CRC and adjacent non-cancerous tissues (p = 0.060).