بررسی

Abstract

سرطان کولورکتال تک¬گیر (CRC)یکی از شایع¬ترین بدخیمی¬ها و سومین عامل اصلی مرگ¬ومیر ناشی از سرطان در دنیا می¬باشد. تشخیص به موقع سرطان کولورکتال در بیماران در مراحل اولیه باعث افزایش نرخ بهبودی می¬شود. تغییرات اپی¬ژنتیکی نقش مهمی در ایجاد و پیشرفت CRC بازی می¬کنند و نماینده¬ی تغییرات اولیه در سلول¬های سرطانی هستند و قبل از بروز هرگونه تظاهرات مورفولوژیک در سلول سرطانی ایجاد شده و تاثیرات خود را اعمال می کنند، بنابراین به نظر می¬رسد که تشخیص این تغییرات در موارد CRCمی¬توانند به عنوان بیومارکرهای نوید بخش به حساب بیایند. نشان داده¬شده¬است که ژن¬های SEPT9 و NTRK3 به صورت نابجا متیله می-شوند و شناسایی آن¬ها احتمالا می¬تواند به عنوان مارکر در تشخیص زودهنگام CRC استفاده شود.روش کار: در این مطالعه ما سطح متیلاسیون پروموتر این ژن¬ها را در بیماران CRC بررسی کردیم. DNA ژنومیک از 45 نمونه¬ی توموری و حاشیه نرمال تومور استخراج شد و تحت تاثیر واکنش سدیم بی¬سولفیت قرارگرفت. پس از طراحی پرایمر برای نواحی مورد نظر در نهایت میزان متیلاسیون پروموتر ژن¬هایSEPT9 و NTRK3 بوسیله¬ی روش نیمه¬کمیMS-HRM مشخص شد.یافته¬ها:نتایج ما نشان داد که تفاوت معنی¬داری از لحاظ آماری در متیلاسیون ژنNTRK3و بخصوص ژنSEPT9 بین نمونه¬های بافت توموری و حاشیه¬ی تومور وجود داشت(p<0.001). قدرت تفکیک بالا بین بافت تومور و بافت نرمال عاری از تومور در جایگاه ویژه¬ای در ناحیه¬ی پروموتر ژن SEPT9مشاهده شد. همچنین هیچ همبستگی معنی¬داری بین متیلاسیون این نواحی و ویژگی¬های بالینی و پاتولوژیکی بیماران اعم از مرحله و درجه¬ی تومور وجود نداشت., Colorectal cancer (CRC) is one of the most common malignancies and the third leading cause of cancer mortality worldwide. Timely detection of CRC in patients with earlier stages provides the highest rate of survival. Epigenetic alterations play important roles in the occurrence and progression of CRC and represent as the primary modifications of cancer cells; they appear and impose their modifications prior to the appearance of any morphological changes in cancerous cells. Therefore, it seems that detection of these alterations in CRC cases are thought to hold great promise as diagnostic biomarkers. It has been shown that SEPT9 and NTRK3 genes are aberrantly methylated and their detection can be used as markers for early diagnosis of CRC.Methods & material: In this study, we analyzed promoter methylation status of these genes in CRC patients. Genomic DNA was extracted from 45 CRC and paired adjacent normal tissues and undergone sodium bisulfite conversion; after primer design for intended locations, finally the methylation status of NTRK3 and SEPT9 gene promoters were defined by semi-quantative MS-HRM assay. Results:Our results showed that there are statistically significant differences in the methylation status of NTRK3 gene and specially SEPT9 gene between CRC and adjacent normal tissues (p <0.001). Higher resolution between tumor and normal tumor-free tissue was observed in a specific location of SEPT9 promoter region. Moreover, there was no significant correlations between methylationof these locations andclinicopathological features of patients such as tumor grade and stage.