شناسایی ژن¬های مرتبط با عقب ماندگی ذهنی اتوزوم مغلوب غیر سندرمی در هفت خانواده بزرگ ایرانی آذری به روش توالی یابی اگزوم

Abstract

هدف از این مطالعه، شناسایی ژن عامل عقب ماندگی ذهنی غیرسندرمی اتوزومی مغلوب در پنج خانواده با ازدواج خویشاوندی از شمال غرب کشور به روش تعیین توالی اگزومی می باشد. بنابراین در این مطالعه برای شناسایی نقص¬های ژنتیکی سندرمی و غیرسندرمی ناتوانی ذهنی در برخی خانواده¬های ایرانی با ازدواج خویشاوندی از تکنیک WES استفاده شده است.بعد از آنالیز نتایج WES،توالی یابی سنگر به منظور تأیید واریانت¬های بالقوه پاتوژن همچنین آنالیز تفکیکی انجام می¬شود.از 7 خانواده¬ی مورد مطالعه یک مورد به علت ابتلا ء به سندرم ایکس شکننده از مطالعه خارج شد، سپس توالی یابی اگزوم برای 6 خانواده¬ی دیگر انجام شد.در نهایت جهش¬های هموزیگوت متنوعی را در کروموزوم¬های مختلف در پروباند¬های این 6 خانواده با استفاده از توالی یابی اگزوم شناسایی شد.آنالیز داده¬ها با استفاده از داده¬های بیوانفورماتیکی و مطالعه¬ی co-segregation 4 جهش جدید را در 4 خانواده آشکار کرد.دوجهش حذف از نوع تغییر چارچوب در ژن ASPM، یک جهش nonesence در AP4E1 و یک جهش missence در MECP2 به عنوان علل ژنتیکی ناتوانی ذهنی در این خانواده¬ها شناسایی شد. در دو خانواده¬ی¬ دیگر هیچ واریانت کاندیدی یافت نشدکه در مرحله بررسی از طریق توالی یابی ژنوم قرار دارند. , Intellectual disability (ID) is a major health problem with extensive genetic heterogeneity and wide variety of phenotypes. The diversity of this disorder requires a genome-wide detection of all types of genetic variation. Recently, whole-exome sequencing (WES) of ID patients revealed novel genes and mutations implicated in the disease. WES is a powerful technique for identifying sequence changes in the human genome.Method; Therefore, we performed WES study to delineate the genetic defects of non-syndromic and syndomic ID in some consanguineous marriage Iranian families. After analyzing WES results, Sanger sequencing was used to approve potential pathogenic variants that were also subjected to segregation analysis in families.At first, seven families have been included in this study of which one excluded because of affecting with fragile X syndrome. Therefore, WES was performed for six families.Result:we identified various homozygous mutations on different chromosomes in six probands using WES. Data analysis using bioinformatic databases and co-segregation study revealed four novel homozygous mutations in four families. Two deletion mutations lead to frameshift in ASPM, one nonsense mutation in AP4E1 and missense mutation in MECP2 were identified as the genetic causes of ID in these families. The rest families without any candidate variation are supposed to check by Whole genome sequencing.