بررسی ژنوتایپ‌ص ایزوله های انسانی و دامی اکینوکوکوس گرانولوزوس با استفاده از ژن میتوکندریال سیتوکروم اکسیداز 1 (cox1) به روش تعیین توالی نوکلئوتیدها در تبریز
Abstract
Introduction: Hydatidosis as one of important zoonotic parasitic disease has posed many health and economic losses annually. So far, 10 genotypes (G1-G10) of Echinococcus granulosus species have been identified based on mitochondrial DNA analysis. Due to diversity and distribution of intermediate hosts in different parts of Iran and world, there are probably differences in parasite genotypes. Purpose: This study was conducted in order to Genotyping of Echinococcus granulosus isolates from human and herbivores using mitochondrial cytochrome oxidase 1(cox1) gene by sequencing method in Tabriz. Materials and Methods: In this study, 45 hydatid cyst samples, including 10 human samples from Imam Reza hospital of Tabriz, 19 sheep samples and16 bovine samples from the slaughterhouse of Tabriz, were collected. DNA was extracted from protoscoleces of human, sheep and germinal layer of bovine samples. After PCR and electrophoresis, Samples were sequenced and then was performed Genotypic and phylogeny analysis with the appropriate software. Results: After genotyping, all 16 bovine samples were G1B subtype (sheep strain).out of 19 sheep samples; one sample G3 genotype (Buffalo strain), one sample G1D and 17 samples G1B subtype were reported. Of 10 human samples, 7 and 3 samples were obtained G1B subtype and G3 genotype respectively.,
مقدمه: هیداتیدوزیس به عنوان یکی از مهمترین بیماری های انگلی زئونوز سالیانه زیانهای بهداشتی و اقتصادی زیادی را به دنبال می آورد. تاکنون 10 ژنوتایپ (G1-G10) از گونه های اکینوکوکوس گرانولوزوس بر اساس آنالیز هایDNA میتوکندریال شناسایی شده‌صاند. این مجموعه به چهار گونه E. granulosus sensu stricto (G1-G3)، E. equinus (G4)، E. ortleppi (G5) و E. canadensis (G6-G10) تقسیم بندی شده است. با توجه به تنوع توزیع میزبانان واسط در مناطق مختلف جهان و ایران احتمال تفاوت در ژنوتایپ انگل در مناطق مختلف نیز وجود دارد.هدف: از آنجائیصکه بررسی ژنوتایپ‌صها در یک منطقه جغرافیایی میصتواند در تهیه واکسن جهت پیشگیری از انتقال عفونت به میزبانان واسط در آن منطقه مؤثر باشد، لذا این مطالعه به منظور بررسی ژنوتایپ صایزوله‌صهای انسانی و دامی اکینوکوکوس گرانولوزوس بر اساس ژن میتوکندریال سیتوکروم اکسیداز 1 (cox1) در شهرستان تبریز انجام گرفت.مواد و روش کار: در این مطالعه 45 نمونة کیست هیداتیک شامل 10 نمونة انسانی از بیمارستان امام رضا (ع) تبریز، 19 نمونة گوسفندی و 16 نمونة گاوی از کشتارگاه تبریز جمع آوری شدند. DNAاز پروتواسکولکس نمونه های انسانی و گوسفندی و لایه زایای نمونه های گاوی استخراج گردید. نمونه ها بعد از PCR و الکتروفورز، تعیین توالی شدند و سپس با نرم افزار های مربوطه، آنالیزهای ژنوتایپی و فیلوژنی انجام گرفت.یافته ها: بعد از تعیین ژنوتایپ، تمام 16 نمونه گاوی ساب تایپ G1B (سویه گوسفندی) به دست آمد. از 19 نمونه گوسفندی، یک نمونه ژنوتایپ G3(سویه بوفالو)، یک نمونه G1D و 17 نمونه ساب تایپ G1B گزارش شد. از 10 نمونه انسانی 7 مورد G1B و 3 نمونه ژنوتایپ G3 بدست آمد