بررسی بیان ژنهای شناسایی شده از طریق تجزیه و تحلیل شبکه های بیان ژنی از طریق سیستم بیولوژی در سلول های سرطان ریه ی مقاوم شده به شیمی درمانی

Abstract

سرطان ریه بعنوان یکی از مهمترین عوامل مرگ و میر در دنیا شناخته می شود. امروزه ، بیمارانی که از سرطان ریه رنج می برند ، عمدتا شیمی درمانی برای درمان یا کنترل سرطان ریه انجام می دهند. شیمی درمانی و درمان های هدفمند به طور قابل توجهی پیش آگهی بیماران را بهبود بخشیده است. با این وجود، پس از پاسخ اولیه موفقیت آمیز، برخی از بیماران زمانی که سلول های سرطانی به درمان های دارویی مقاوم می شوند، عود می کنند. متاسفانه بدلیل سختی های بیماری و مصرف زیاد دارو های شیمی درمانی در طی درمان این نوع سرطان اکثر بیماران سرطان ریه دارای مقاومت دارویی به دارو ها بخصوص داروی Cisplatin از خود نشان می دهند. Cisplatin یک عامل شیمی درمانی شناخته شده با اثرات بالینی عالی است. فعالیت ضد توموری Cisplatin در سرطان های مختلف مانند از جمله سرطان ریه نشان داده شده است. با این حال، مقاومت سلول های سرطانی به شیمی درمانی Cisplatin منجر به شکست آن در ریشه کنی سلول های سرطانی و متعاقب آن مرگ بیماران مبتلا به سرطان شده است. خوشبختانه، تلاش زیادی برای شناسایی مسیرهای مولکولی و مکانیسم‌های دخیل در مقاومت Cisplatin انجام شده است. مطالعات نشان داده است تغییر بیان در سطح ژن های کلیدی می تواند القای مقاومت دارویی را در بیماران دارای سرطان ریه تسریع و یا تحت تاثیر قرار دهد. در سال های اخیر، فناوری microarray و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک به طور گسترده ای برای غربال کردن تغییرات ژنتیکی در سطح ژنوم مورد استفاده قرار گرفته است که به ما در شناسایی ژن های بیان شده متفاوت و مسیرهای عملکردی درگیر در سرطان زایی و پیشرفت سرطان ریه کمک کرده است. مواد و روش ها: در این مطالعه ما با استفاده از داده های موجود در وبسایت Gene Expression Omnibus (GEO) پیرامون بیان ژن ها در نمونه های سلولی سرطان ریه مقاوم به Cisplatin ژن های دارای بیان تغییر یافته با استفاده از نرم افزار R شناسایی شدند. سلول های سرطانی A549 سرطان ریه نسبت به داروی Cisplatin مقاوم شدند و IC50 دارو در تمام مراحل با استفاده از تست MTT مورد ارزیابی قرار گرفت. سطح بیان ژن های کاندید نیز با استفاده از روش qRT-PCR بررسی شد. یافته ها: بعد از مقاوم سازی سلول های سرطان ریه در آزمایشگاه و بررسی بیان ژن های کاندید، نتیجه بدست آمده نشان داد که ژن های CEACAM1 ، DGKA ، ARHGEF2 و THSD4 دارای بیان تغییر یافته هستند و سطح IC50 داروی Cisplatin در سلول های مقاوم شده حدود 11 برابر شده است.