Show simple item record

dc.contributor.authorجنت دوست, زهرا
dc.date.accessioned2021-04-05T07:07:25Z
dc.date.available2021-04-05T07:07:25Z
dc.date.issued1399en_US
dc.identifier.urihttp://dspace.tbzmed.ac.ir:8080/xmlui/handle/123456789/63976
dc.description.abstractمقدمه: آنزیم سیکلواکسیژناز و واسطه ی آن PGE2 سایتوکاین التهابی هستند که بر گیرنده‌های مختلف مسیر سرطان کولون تاثیر می‌گذارد. مطالعه ترکیبات موثر بر این مسیرها در جریان درمان سرطان کولون، حائز اهمیت است. هدف: پیش بینی طیف فعالیت ضدالتهابی ترکیبات با اثر ضد سرطان کولون در مسیر COX/PGE2. روش کار: در این مطالعه پس از انتخاب پروتئین‌های موثر با استفاده از دیتابیس KEGG، اندیس تشابه تانیموتو مبتنی بر fingerprintها محاسبه شده، تارگت‌ها برای هر ترکیب پیشبینی شده و ترکیبات موثر بر جفت تارگت‌ها انتخاب شدند. جهت بررسی برهمکنش ترکیب‌های منتخب با تارگت‌های پیشبینی شده، از روشهای داکینگ مولکولی استفاده شد. جهت انجام مطالعه یک روش داده کاوی سیستماتیک با استفاده از پلت فرم Knime توسعه داده شد. همچنین دیتاسرور مورد نیاز برای استفاده آفلاین، با نرم‌افزار MYSQL و پایگاه داده Chembl25 ایجاد گردید. نتایج: در ابتدا از پایگاه KEGG 32 تارگت و 15900 ترکیب انتخاب گردید که پس از اعمال فیلترهای مربوطه 14800 ترکیب برای 32 تارگت در قالب جفت تارگت انتخاب شدند. پس از بررسی اهمیت جفت تارگت‌ها، GSK3-I kappa B kinase و PI3 kinase-mTOR و GSK3_CD1 و GSK3_PKB و_PKB PI3 kinase به دلیل وجود شواهد مبنی بر اثرات سینرژیستی پروتئین‌های هر جفت، انتخاب شدند. جهت بررسی احتمال صحیح بودن یک جفت تارگت پیشبینی شده برای مطالعه تکمیلی؛ برهمکنش یک ترکیب مهارکننده برای هر یک از پروتئین های GSK و IKKA به روش داکینگ مولکولی مورد بررسی قرار گرفت. نتیجه گیری: با استفاده از روش توسعه داده شده در این مطالعه، ترکیبات موثر روی جفت تارگت‌های دارای اثر سینرژیستی در سرطان کولون شناسایی شد. روش داده کاوی به کار رفته امکان انجام مطالعاتی با تعداد فراوان تارگت و لیگند را در 20 دقیقه فراهم کرد. از نتایج حاصل از این روش می توان برای پیشبینی تارگت و پیدا کردن ترکیب پیشرو استفاده کرد.en_US
dc.language.isoenen_US
dc.publisherدانشگاه علوم پزشکی تبریز، دانشکده داروسازیen_US
dc.relation.isversionofhttp://dspace.tbzmed.ac.ir:8080/xmlui/handle/123456789/63972en_US
dc.subjectآنزیم سیکلواکسیژنازen_US
dc.subjectالتهابen_US
dc.subjectسرطان کولونen_US
dc.subjectپروستاگلاندین E2en_US
dc.subjectدیتابیسen_US
dc.subjectپلت فرم Knimeen_US
dc.subjectداکینگ مولکولیen_US
dc.titleپیش بینی طیف فعالیت ضد التهابی ترکیبات با اثر ضد سرطان کولون در مسیر COX/PGE2en_US
dc.typeThesisen_US
dc.contributor.supervisorسلطانی, سمیه
dc.contributor.supervisorوولبر, گرهارد
dc.identifier.callno216en_US
dc.description.disciplineداروسازیen_US
dc.description.degreeدکترای عمومیen_US


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record