اساس مولکولی مقاومت پلاسمیدی کینولون PQMR و ارتباط آن با ژن های اینتگراز در ایزوله های بالینی اشرشیا کلی و کلبسیلا پنومونیه به همراه تعیین الگوی ژنی سویه های PQMR به وسیلهERIC-PCR

Abstract

Objective: To determine the prevalence of PMQR among quinolone resistance isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae, their relation with integrase genes and genome typing of PMQR isolates by ERIC- PCR. Materials and Methods: During 9 months,134 quinolone resistance isolates of E. coli and K. pneumonia were collected from Sina hospital in Tabriz, Iran. Extended-spectrum -lactamases (ESBL) production were tested. Minimum Inhibition Concentration (MIC) of isolates against ciprofloxacin and nalidixic acid was determined by using E-test. The isolates were screened for (PMQR) qnrA, qnrB, qnrS , aac(6)-Ib-cr and qepA by Polymerase Chain Reaction( PCR) and integrase gene was assessed. All PMQR isolates were typed by ERIC-PCR. Results: Of 134 isolates, 71 of them were E. coli and 63 K. pneumoniae. Prevalence of qnrA, qnrB and qnrS in were 3.7%, 10.5% and 9.7% respectively. 49.2% of isolates for aac (6)-Ib-cr and 14.9% for qepA were positive. Integrons were found in 60.5% of isolates. In E.coli 29.5% and 15.9% of isolates had intI1 and intI2 respectively. In K.pneumoniae 38% and 17.4% of isolates had intI1 and intI2. The results of ERIC-PCR showed that 79.4% of E. coli strains and K. pneumoniae 53% have different types of DNA band., اهدف:میزان شیوع PMQR در میان ایزوله های مقاوم به کینولون در اشرشیا کلی و کلبسیلا پنومونیه و ارتباط آن با ژن های اینتگراز و تعیین الگوی ژنی ایزوله های PMQR به روش .ERIC-PCRمواد و روش ها:در طول 9 ماه، 134 ایزوله ی مقاوم به کینولون اشرشیا کلی و کلبسیلا پنومونیه از بیمارستان سینای تبریز، جمع آوری گشت و تولید بتالاکتاماز های وسیع الطیف (ESBL) آزمایش گردید. حداقل غلظت مهاری (MIC) ایزوله ها برای سیپروفلوکساسین ونالیدیکسیک اسید با روش E-test صورت پذیرفت. ژنهای(PMQR) qnrAو qnrBو qnrS و aac(6)-Ib-crوqepA توسط واکنش زنجیره ایی پلیمراز(PCR) غربالگری وهمچنین حضور ژن های اینتگراز مورد بررسی قرار گرفت. تعیین الگوی ژنی ایزوله های دارای PMQR توسط ERIC-PCR مشخص گشت. نتایج: از میان 134نمونه،71 ایزوله اشرشیا کلی و63 کلبسیلا پنومونیه بودند. ژن qnr در 5/16% از ایزوله ها یافت شد که 14% در اشرشیاکلی و 19% در کلبسیلا پنومونیه تخمین زده شد . شیوع qnrA و qnrB و qnrS به ترتیب 7/3% ، 5/10% و 7/9% بود. 2/49% از ایزوله دارای ژنaac (6)-Ib-cr و 9/14% دارای ژن qepA بودند. اینتگرون در 4/60% ایزوله ها یافت شد. در اشرشیا کلی 5/29% دارای اینتگرون کلاس1و 9/15% حاوی اینتگرون کلاس2بودند. درکلبسیلاپنومونیه 38% دارای اینتگرون کلاس1و 4/17% دارای اینتگرون کلاس2 بودند. نتایجERIC-PCR نشان می دهد که4/79% از گونه های اشرشیا کلی و53% از کلبسیلا پنومونیه ها منشاء مختلف نشان دادند.